Bài trí bàn thờ đúng cách sẽ giúp cho việc cúng lễ được tôn nghiêm và thiêng liêng hơn. Trong cùng bàn thờ, tấm bài vị được dán lên vách. Sau lưng bàn độc Thần Tài cần phải là vách tường kiên cố, không được trổ cửa sổ hay đục lỗ với mục đích giữ tài vận không thất thoát ra bên ngoài.
Với một số trường hợp, khi chọn hướng hợp phong thủy thì bàn thờ Thần Tài sẽ không dựa lưng vào tường được Trong những trường hợp đó cần tạo vách để tránh góc nhọn sau lưng bàn thờ và giúp bàn độc nằm vững chắc.

Phong thủy tam nguyên
Vị trí đặt tượng Thần Tài và Thổ Địa trên bàn thờ: Theo nguyên tắc từ ngoài nhìn vào, bên trái là ông Thần Tài, bên phải là thổ công (thường bàn độc Thần Tài thờ chung với ông thổ công).
Bài trí các lễ phẩm trên bàn thờ: Ở giữa hai ông là một hũ gạo, một hũ muối và một hũ nước đầy. Ba hũ này không cần phải thay trực tính, chỉ đến cuối năm mới thay vì như vậy sẽ giúp giữ tài lộc cho cửa hàng của bạn. Giữa bàn thờ đặt một bát nhang, khi lau chùi lưu ý tránh động vào. Hoa quả đặt trên bàn độc phải là hoa qua tươi. Lọ hoa được đặt bên tay phải, đĩa trái cây bên tay trái. huê hồng, hoa cúc, hoa đồng tiền là các loại hoa thường được các gia chủ dùng để cúng Thần tài. Trái cây theo truyền thống nên chọn ngũ quả. Xếp 5 chén nước thành hình chữ thập để biểu tượng cho ngũ phương và ngũ hành nảy sinh phát triển. Ông Cóc để bên trái, sáng quay Cóc ra, tối quay Cóc vào với ý thu về tài lộc.
Ngoài cùng trên mặt đất, nên chọn một cái bát hoặc đĩa sâu sứ hoặc thuỷ tinh thật đẹp, đổ đầy nước và rắc những cánh Hoa hồng trên mặt (đĩa hoa này biểu tượng cho việc giữ tiền bạc khỏi trôi đi). Theo tục truyền, Di Lặc Phật Vương sẽ là người quản lý và ngăn chặn các vị thần làm điều sai lầm nên bên trên bàn thờ Thần Tài, có thể đặt thêm tượng Phật Di Lặc.